Metodos - Riqueza de especies rarefaccionada

2.6. Riqueza de especies rarefaccionada

La riqueza de especies observada depende, en general, del esfuerzo de muestreo. Si el esfuerzo no
es completo (i.e., censo estricto), cuanto más individuos son capturados, más especies se registran
(e.g. Gotelli y Colwell 2001, Sackmann et al. 2005). Por lo tanto es importante estandarizar la
riqueza de especies por el esfuerzo de muestreo realizado para poder comparar la variación en la
riqueza entre ambientes o entre estaciones de muestreo. En este trabajo se calcularon dos tipos de
rarefacción: 1) las curvas de rarefacción por el número de estaciones de muestreo, para comparar
la riqueza de especies entre ambientes y 2) la riqueza de especies rarefaccionada por el número de
individuos capturados, para comparar la riqueza de especies entre sitios.
1. Elaboración de las curvas de rarefacción por el número de muestras (estaciones de muestreo)
Debido a que los ambientes tuvieron un número diferente de estaciones de muestreo se
realizaron curvas de rarefacción estandarizando por el número de estaciones. La construcción
de curvas de rarefacción puede ser vista como un proceso de interpolación desde la riqueza
de especies del total de muestras a los valores esperados de riqueza para un sub conjunto
de muestras (Colwell et al. 2004). Se calculó una curva de rarefacción para los ambientes
de bosque, matorral-estepa, matorral y estepa, que se compararon con una curva para los
tres ambientes en forma combinada. El procedimiento consistió en estimar la riqueza de
especies esperada para 1, 2... N muestras, siendo N el número total de estaciones de muestreo
para cada caso (bosque N= 17, matorral-estepa N= 33, matorral N= 9, estepa N= 24). Este
procedimiento se realizó mediante un remuestreo al azar repetido 10.000 veces, utilizando el
programa EstimateS (Colwell 2000). Se elaboraron las curvas de rarefacción, donde el número
promedio de especies esperado fue graficado en función del número acumulado de individuos.
La riqueza rarefaccionada se reescaló en función del número de individuos porque los conjuntos
de datos difieren en el número de individuos por muestra (Gotelli y Colwell 2001).
2. Riqueza de especies rarefaccionada por el número de individuos capturados
Esta variable se utilizó como variable respuesta en los modelos ecológicos y espaciales. Se
calculó para estandarizar las comparaciones en la riqueza observada entre sitios debido a que
la abundancia de individuos por sitio pudo diferir por razones no vinculadas a la abundancia
real del sitio, dificultándose la comparación de la riqueza entre sitios. Se estimó la riqueza
rarefaccionada por el número de individuos capturados para cada sitio y dentro de cada
ambiente (bosque y matorral-estepa) y para el conjunto de ambientes. Para lo cual: 1) Se
seleccionó el sitio con menor número de individuos colectados (un sitio con 5 individuos en el
bosque y otro con 7 en el matorral-estepa). 2) Se estimó para cada uno de los sitios restantes la
riqueza de especies esperada si el número de individuos colectado hubiese sido 5 o 7 individuos.
Los cálculos se realizaron con el programa ECOSIM 7.0 (Gotelli y Entsminger 2001), mediante
el cual se realizó, para cada sitio, un remuestreo al azar repetido 10.000 veces, de 5 (bosque)
o 7 (matorral-estepa) individuos del conjunto de N individuos capturados para ese sitio. De
esta forma se estandarizó por el número de individuos capturados.